Кредитная организация была зарегистрирована в 1992 году в форме товарищества с ограниченной ответственностью. В качестве учредителей и первых клиентов банка выступили нефтяная компания ОАО «Лукойл» (тогда «Лангепас-Урай-Когалымнефтегаз»), нефтегазовая корпорация «Би-Газ-Си», а также несколько НИИ и предприятий, связанных с электроникой и авиацией, в т.ч. ВАО «Электроноргтехника» и ОАО «НИАТ».
Сегодня банк числится в составе холдинга «ИФД КапиталЪ», а основными его бенефициарами являются известные миллиардеры Леонид Федун и Вагит Алекперов, осуществляющие контроль над 79,39% акций через кипрскую Reserve Invest Holding. Негосударственный пенсионный фонд «Лукойл-Гарант» владеет 10,47%, еще 6,64% принадлежит президенту «Петрокоммерца» Владимиру Никитенко.
На сегодняшний день «Петрокоммерц» выступает как основной расчетный банк группы «Лукойл», осуществляя конверсионные операции и расчетно-кассовое обслуживание, а также ведя зарплатные проекты входящих в группу компаний. Всего кредитная организация обслуживает свыше 230 тысяч физических лиц, выступающих в роли вкладчиков, около 46 тысяч частных заемщиков (в основном сотрудников компаний-клиентов), а также 25 тысяч юридических лиц. «Петрокоммерц» является одним из лидеров на рынке банковских карточек, эмитировав к настоящему времени свыше 1,6 миллиона карт систем MasterCard и Visa.
Всего банковская сеть группы «Петрокоммерц» (включающая еще 3 банковских учреждения — «Банк Петрокоммерц-Украина», «Ставропольпромстройбанк» и «Ухтабанк») насчитывает 166 точек продаж (116 на территории России), около 1500 банкоматов и свыше 7 000 POS-терминалов.
Кроме депозитов физических лиц, банк фондируется благодаря вкладам организаций и предприятий, которые формируют порядка 25% пассивов. Еще 16% приходится на остатки на расчетных счетах корпоративных клиентов. Кредитный портфель формирует практически половину нетто-активов банковской организации. Уровень просроченной задолженности в нем — 11%. На портфель ценных бумаг приходится немногим более 15% активов. На рынке межбанковского кредитования «Петрокоммерц» обычно примеряет роль нетто-кредитора.